قبور امامزادگان با کاشى‏هاى معرّق زیبایى پوشیده شده و داخل صندوق چوبى مشبّکى قرار گرفته‏اند. در میان سقف آجر چینى این بقعه، ترنج گردى با کاشى‏هاى معرّق عهد مغول ـ نظیر کاشى‏هاى روى قبر امامزادگان ـ ساخته شده است. پیرامون ترنج، آجر کارى‏هایى به شیوة رسمى بندى و سپس تزیینات مقرنس انجام گرفته است.

گنبد شرقى که همان خانقاه کهن مى‏باشد، پس از در گذشت حاج ملّا محمّد حسن قطب نطنزى ـ از عارفان و قطب‏هاى سلسلة نعمت اللهى ـ بر روى آرامگاه او ساخته شد و تزییناتى در داخل آن به اجرا در آمده است.

باید یاد آور شد که در میان فرزندان حمزه بن موسى(ع)، نامى از اسحاق و ابوطالب در کتب انساب یافت نمی‌شود و علماى انساب تنها براى آن امامزادة عظیم الشأن ـ که آرامگاهش در شهر رى است ـ سه فرزند به اسامى على، قاسم و حمزه ذکر نموده‏اند. بعید نیست که امامزاده اسحاق و ابوطالب از نوادگان حمزه بن حسین بن احمد بن اسحاق بن ابراهیم بن موسى ابى سبحه بن ابراهیم المرتضى بن امام موسى کاظم(ع) باشند که قبر وى در خیابان آذر شهر قم قرار دارد و به شاهزاده حمزه مشهور و معروف است.